Miljøverndepartementet og Olje- og energidepartementet fastsatte den 23. desember 2009 endringer i vannforskriften. Bakgrunnen for endringene var forvaltningsreformen, ny plan- og bygningslov, samt at fristene må tilpasses den nye landsomfattende planleggingsperioden fra 2010 til 2015. Som del av endringene er det vedtatt å øke antallet vannregionmyndigheter fra 9 til 11, og å framskynde flere av høringsfristene som inngår i planleggingsprosessen.